Conozco dos forma para forzar la ejecución de fsck para verificar el sistema de archivos al momento de bootear.
- Vía shutdown:
shutdown -rF tiempo
donde r (reinicia) y F indica verificar el sistema de archivos, tiempo es el desfase para reiniciar expresado la hora de reinicio (12:33) o como un delta en minutos (+30)
- Vía archivo forcefsck (como root)
touch /forcefsck
Al reiniciar se verificará el sistema de archivos